肾脏巨噬细胞是一群长期定居于肾脏内部的组织固有巨噬细胞，对维持肾脏功能稳态，抗感染和组织修复起到重要的作用。传统认为，血液循环中的单核细胞是包括肾脏在内组织的巨噬细胞的主要来源，单核细胞可以迁移到组织内部并进一步分化成巨噬细胞。近年来，随着遗传谱系示踪技术的进步，这一观念受到质疑。目前研究认为，正常机体内大多数组织巨噬细胞来源于胚胎时期，出生后部分组织例如肠道中的巨噬细胞被骨髓来源的外周单核细胞代替，而在某些组织例如大脑和肝脏中，巨噬细胞通过自我更新来维持，不需要外周的贡献。单核细胞对不同组织巨噬细胞的贡献具有组织特异性，巨噬细胞的来源和更新是免疫学中重要的基础问题之一。其中肾脏巨噬细胞的确切来源还不清楚，尤其是不同来源的肾脏巨噬细胞是否有表型和功能差异还未被阐明。
肾脏髓质巨噬细胞的伪足并不是简单包绕在肾小管周围，而是部分地嵌入管壁伸入到管腔；穿管过程也很奇特，它们直接穿越了胞体，而不是从细胞间的缝隙钻过。如图所示，肾脏髓质巨噬细胞长长的伪足伸入管腔。尿路里存在“管道清理工"，即肾脏髓质巨噬细胞，清除肾小管内颗粒物从而避免尿路堵塞，这有望对肾结石等疾病提供新的预防和治疗方案。科学家可以寻找特殊的药物分子，去靶向增加肾髓质巨噬细胞的跨管伪足发生和细胞向管内的迁移行为，从而提升肾小管内颗粒物的清除效率。肾巨噬细胞在监测尿液内容物和促进尿液沉积颗粒的清除方面发挥着重要作用，这一特征的潜在利用可能有利于开发肾结石和肾脏特异性药物输送的治疗方法。
