中枢小胶质细胞是遍布大脑和脊髓的一种神经胶质细胞。小胶质细胞是中枢神经系统（CNS）的常驻巨噬细胞，约占中枢神经系统细胞总数的 10%，在维持体内平衡、应对损伤和炎症以及清除细胞碎片方面发挥着重要作用。小胶质细胞功能失调与一系列神经系统疾病有关，包括阿尔茨海默症和多发性硬化症。外周小胶质细胞，人体外周神经系统内存在小胶质细胞，打破了学界的传统认知，是全新发现。物种体型越大，外周神经元胞体越大，外周神经系统中的小胶质细胞数量也就越多；反之，物种体型越小，其胞体越小，外周神经系统中的小胶质细胞数量也就越少甚至就缺失。这就是例如在小鼠和大鼠这一类体型较小的脊椎动物中就并不存在和没有被发现的原因。
活化的小胶质细胞可以充当抗原呈递者并分泌细胞因子来触发后续的免疫反应。通过高度敏感的吞噬过程延伸到多个位置，它们可以连续检测并吞噬受损的细胞、传染原、碎片和噬菌斑。由于它们具有监测和清除中枢神经系统的多方面能力，因此这些细胞对于损伤修复反应至关重要，并与神经退行性疾病有关。小胶质细胞在大脑发育过程中也是必需的，因为它们对于树突状修剪至关重要，而在成熟的大脑中，它们有助于维持体内平衡环境。
小胶质细胞特异性标志物包括细胞表面标志物、细胞内标志物和功能性标志物。细胞表面标记物是小胶质细胞外膜上的蛋白质，在识别和描述细胞类型、活化和功能状态以及疾病相关影响方面起着至关重要的作用。细胞内标记物位于小胶质细胞内部，用于研究特定的细胞过程、信号通路和活化状态。功能标记物与特定的小胶质细胞功能有关，包括炎症反应、神经保护、组织修复和疾病相关变化。小胶质细胞特异性标记物是研究、诊断和针对神经系统疾病中的小胶质细胞活动进行潜在治疗干预的重要工具。通常通过观察细胞特异性胞内蛋白的表达来确定小胶质细胞，如 Iba1/AIF-1、CD11b 和 TMEM119。F4/80就不用介绍了，巨噬细胞的基础核心前置标志物。其是一种位于巨噬细胞和静息小胶质细胞表面的糖蛋白，分子量为 160 KDa。
IBA1/AIF-1 ：离子钙结合衔接分子 1 (Iba1) 是小胶质细胞和巨噬细胞特异性的钙结合蛋白，参与激活的小胶质细胞的细胞膜皱褶形成和吞噬作用。是一种进化上保守的钙结合蛋白。作为 F-肌动蛋白结合蛋白，Iba1/AIF-1 可能会重塑小胶质细胞的肌动蛋白细胞骨架。Iba1/AIF-1 在单核细胞谱系的细胞中专一表达，因此，靶向该蛋白的抗体被广泛用于标记大脑和其他组织中的小胶质细胞/巨噬细胞。
TMEM119： 是功能未知的跨膜蛋白，几乎在所有小胶质细胞中均特异性表达。巨噬细胞或其他免疫细胞类型不表达这种受发育调节的蛋白质。检测 TMEM119 的抗体充当特定的细胞表面标志物，以可视化小胶质细胞。该标志物同时也是鼠源和人源小胶质细胞的特异性标记物。TMEM119 的特点是其不在巨噬细胞或其他免疫/神经细胞上表达，这一点不同于其他小胶质细胞标记物。
CX3CR1：是一种趋化因子受体，存在于CNS中小胶质细胞和巨噬细胞的表面，可被神经元分泌的CX3CL1（趋化因子）激活。CX3CR1是分形趋化因子（Fractalkine）CX3CL1的受体，属于G蛋白偶联受体（GPCR）家族。在外周组织中，它主要在巨噬细胞、淋巴细胞、树突状细胞等的表面表达，参与细胞存活、增殖、细胞间粘附、迁移等。在中枢神经系统中，CX3CR1主要在小胶质细胞和巨噬细胞中表达，并被用作这些细胞的标志物。据报道，CX3CR1参与中枢神经系统的发育和稳态。特别是，在CX3CR1缺陷小鼠中，小胶质细胞对突触的修剪不充分，导致神经元之间的突触传递异常，表明CX3CR1在突触修剪中起着重要作用。
ASC/TMS1： 是由人的 PYCARD 基因编码的衔接蛋白，通常在单核细胞、小胶质细胞和巨噬细胞的胞核中表达。这种促凋亡蛋白是炎性体的关键介质，其响应于病原体感染或组织损伤而被触发。在此过程中，它重新定位到核周空间，细胞质和内质以及线粒体，在此处它与 Bax 相互作用以触发细胞色素 c 释放并引起随后的细胞凋亡。ASC/TMS1 也是炎症信号的关键组成部分，因为它响应促炎信号激活 caspase-1。
HS1： 是一种蛋白激酶底物，富含造血细胞。在脑中，HS1 在小胶质细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞中表达。HS1 抗体是突出小胶质细胞和巨噬细胞胞浆的有用工具。
CD11b：跨膜蛋白、分化分子簇 11b（CD11b）/整联蛋白 αM（ITGAM）由先天免疫系统细胞中表达的 α 和 β 异二聚体组成。检测 CD11b/ITGAM 的抗体通常用于鉴定髓系谱系的细胞，包括嗜中性粒细胞、单核细胞、巨噬细胞和小胶质细胞。静息小胶质细胞表面标记物为 CD11bhi 和CD45low。
CD68： 是一种溶酶体蛋白，在巨噬细胞和活化的小胶质细胞表面表达水平较高，而在静息小胶质细胞表面低表达水平低。
氯膦酸盐脂质体体内清除小胶质细胞，是研究其功能简单有效的方法。当我们在使用荷兰Liposoma小胶质巨噬细胞清除剂ClodronateLiposomes时，为了检测清除效果，无论免疫荧光和流式检测，可以根据小胶质细胞的状态，样品特性选择以上标志物。
