什么是棕榈酰化修饰蛋白组?
蛋白质是生命的物质基础,蛋白质要经过基因转录、转录后加工、翻译、翻译后加工及转运等多个复杂过程后才具有生理功能。蛋白质的翻译后加工修饰形式包括磷酸化、糖基化、甲基化、羟基化、泛素化及脂质化等,其中脂质化修饰是一种重要的翻译后加工修饰形式,而N-豆蔻酰化和棕榈酰化是重要的脂质化修饰形式。
蛋白质棕榈酰化修饰一般发生在半胱氨酸残基上,依据其连接方式可以分为S-棕榈酰化、N-棕榈酰化和O-棕榈酰化。N-棕榈酰化是棕榈酰基与甘氨酸/半胱氨酸(Gly/Cys)残基通过酰胺键连接,因酰胺键较稳定,因此不可逆;O-棕榈酰化是棕榈酰基通过酯键与丝氨酸残基相连;S-棕榈酰化是指含有16 个碳原子的饱和棕榈酸和半胱氨酸(Cys)共价结合,形成不稳定的硫酯键,这种棕榈酰化具有可逆性,可在时间和空间上调节蛋白质的功能,因此它是最重要的一种棕榈酰化修饰方式。
蛋白质S-棕榈酰化修饰包括两个过程,第一步发生自酰化,棕榈酰CoA和棕榈酰基转移酶的半胱氨酸通过硫酯键相连,形成酰基酶中间体,并释放游离的CoA-SH。在没有底物时,该中间体会被缓慢地水解;第二步当存在底物时,会将中间体连接的棕榈酰基转移至底物半胱氨酸上。
炔基肉豆蔻酸可用于鉴定和表征翻译后肉豆蔻化的蛋白质。炔基棕榈酸(15-十六炔酸或棕榈酸(15-炔))是一种在ω末端带炔基的改性棕榈酸。炔基棕榈酸常用于利用强大的点击化学方法鉴定和表征蛋白质的翻译后S-棕榈酰化修饰。
Alkynyl myristic acid is can be used to identify and characterize the post-translational myristylated proteins Alkynyl palmitic acid (15-hexadecynoic acid or Palmitic acid (15-yne)) is a modified palmitic acid with an ω-terminal alkyne. Alkynyl palmitic acid often used to identify and characterize the post-translational S-palmitoylation of proteins using the powerful click chemistry